株型不同：东北红豆杉株高20m，胸径可达100cm，树皮红色。而南方红豆杉株高30m，胸径约为60-100cm，树皮灰褐色、红褐色或暗褐色。
生长环境不同：东北红豆杉分布于北方地区，耐低温能力强（可忍耐零下30℃低温），惧高温。而南方红豆杉主要分布于亚热带、暖温带地区，最多可忍耐零下11℃的低温。
一、东北红豆杉与南方红豆杉的区别
1、株型不同
（1）东北红豆杉株高为20米，胸径为1米;树皮颜色为红褐色，枝条比较茂密，叶片为排成不规则的二列，上面为深绿色，下面为气孔带。雄球花有雄蕊，种子紫红色。东北红豆杉5-6月开花，9-10月种子成熟。
（2）南方红豆杉株高为30米，胸径达60-100厘米。树皮灰褐色、红褐色或暗褐色，叶排列成两列，长1-3厘米，宽2-4毫米。雄球花淡黄色，雄蕊8-14枚，花药4-8。
2、生长环境不同
（1）东北红豆杉是属于我国北部地区的，它不喜欢光照，耐低温抗冻，在冬季厚厚的雪当中也能生存。可耐- 30℃以下低温，抗寒性强，最适温度20-25℃。而且害怕高温，而然到了夏天温度一高，生长的就比较慢了。
（2）南方红豆杉是一种亚热带，暖温带地区种植的，但是对于气温的适应能力比较强。另外和东北红豆杉一样不喜欢光照，但是它对于温度的要求没有太过于苛刻，年均温11-16℃，最低极值可达-11℃。
二、红豆杉种子怎么培育成苗
1、红豆杉种子在萌芽之前有非常长一段休眠期，你所看到的优美高大的红豆杉树木在还没形成一棵树苗之初，经历了至少两冬一夏才开始发芽。
2、如果想要它发芽的速度快一些，需要经过低温层积处理，即使这样，也只是确保它在一年之内发芽而已，在它的苗期阶段，生长同样是十分缓慢的。
3、红豆杉种子在室外的培育比较好。
