一、酿制蜂种
土蜂蜜是“土蜂”蜜而不是“土”蜂蜜，也就是说土蜂蜜是土蜂酿制而成的，而土蜂是中华蜜蜂(简称中蜂)的俗称，普遍分布于我国各地山区环境中，最大的特点是善于利用零星蜜源，从而导致土蜂蜜的蜜源极为复杂，事实上土蜂蜜的很多特性也源自于其复杂且多变的蜜源。
二、蜜源构成
土蜂蜜的蜜源极为复杂且差异性非常大，原因是各地的蜜源分布本身存在着较大的差异，同时中蜂有效采集半径内(大约3公里左右)的蜜源也可能不同，另外不同蜂群对蜜源植物也存在不同的偏好，从而导致土蜂采集的蜜源不可能完全相同，进而导致土蜂蜜存在着不同的颜色。
三、颜色差异
土蜂蜜是中蜂采集多种花蜜酿制而成的，由于不同地区蜜源的分布可能存在着的差异，不同蜜源酿制而成的土蜂蜜也有着不同的颜色，甚至同一地区的土蜂蜜在颜色上也可能不同，但相对来说土蜂蜜的颜色普遍比较深，其中比较常见的颜色有深琥珀色、琥珀色及浅琥珀色等。
四、自然结晶
土蜂蜜和其他蜂蜜一样在一定条件会结晶，结晶后土蜂蜜的颜色会逐渐变浅如浅黄色、浅琥珀色等，为什么土蜂蜜结晶后颜色会变浅呢？原因是土蜂蜜结晶其实是葡萄糖析出的过程，而析出的葡萄糖晶体本身是白色的，因此土蜂蜜在结晶后颜色会变浅但绝对不会变成纯白色。
总结：土蜂蜜颜色差异源于复杂且多变的蜜源组成，即便是同一养蜂场的土蜂蜜在颜色上也可能存在差异，因此单从颜色上根本不可能鉴别出土蜂蜜的真假，但相对于其他蜂蜜而言土蜂蜜的颜色普遍较深。
