一、来源不同
人工蜂巢蜜和天然蜂巢蜜的来源不同，其中人工蜂巢蜜是用工业设备生产出来的，原材料是各种糖浆及增稠剂、香精、色素等化学制品；天然蜂巢蜜是蜜蜂采集花蜜酿制成熟并封盖的蜜脾，酿蜜原材料是蜜蜂从花朵上吸取的花蜜。
二、产量不同
人工蜂巢蜜和天然蜂巢蜜的产量不同，其中人工蜂巢蜜只要原材料充足一天就能生产几千甚至上万斤；天然蜂巢蜜的产量因蜂种、蜜源、气候等不同而不同，例如定点饲养的中蜂一年只能生产十几斤甚至几斤蜂巢蜜。
三、成分不同
人工蜂巢蜜和天然蜂巢蜜的成分不同，其中人工蜂巢蜜的主要成分是糖浆，除了糖浆外几乎不含其它营养物质；天然蜂巢蜜的主要成分是葡萄糖和果糖，尚含丰富的氨基酸、维生素、有机酸、矿物质及酶类等活性物质。
四、功效不同
人工蜂巢蜜和天然蜂巢蜜的功效不同，其中人工蜂巢蜜几乎毫无任何营养价值可言，反而会给健康带来危害；天然蜂巢蜜自古就是高级营养食品，经常食用有增强体质、缓解疲劳、润肠通便、排毒养颜、降脂降压等功效。
五、价格不同
人工蜂巢蜜和天然蜂巢蜜的价格不同，其中人工蜂巢蜜的成本低廉且可批量生产，售价一般在二三十元甚至十几元一斤；天然蜂巢蜜的产量低、生产成本高，售价一般在几十元至上百元，有些甚至要数百元一斤。
