1、蜂巢蜜不能长期空腹食用，原因是蜂巢蜜中富含有机酸等酸性物质，加之吃蜂巢蜜还能刺激胃部大量的分泌胃酸，若长期空腹食用容易引起胃酸过多甚至可诱发胃溃疡等胃肠疾病。
2、蜂巢蜜不能长期过量食用，原因是蜂巢蜜中富含葡萄糖和果糖等单糖，单糖虽然不易转化成脂肪，但并不是说单糖完全不能转化成脂肪，事实上长期过量摄入单糖也极易引起肥胖。
3、蜂巢蜜不适合高血糖人群食用，原因是蜂巢蜜中富含的单糖不经胃肠消化就能直接进入血液中，高血糖人群吃蜂巢蜜容易导致血糖进一步升高，另外糖尿病患者也不建议吃蜂巢蜜。
4、蜂巢蜜不适合过敏体质人群食用，原因是蜂巢蜜中含有一定量的过敏原，过敏体质人群食用容易引起过敏，轻者可能出现皮肤瘙痒等不适，严重时可引起呼吸困难甚至过敏性休克。
5、蜂巢蜜不适合婴幼儿食用，原因是蜂巢蜜容易被肉毒杆菌污染，肉毒杆菌对胃肠功能健全的成年人而言几乎没有任何影响，但胃肠功能尚不健全的婴幼儿食用则可能引起食物中毒。
综上所述，蜂巢蜜的禁忌主要有五个，其一是蜂巢蜜不能长期空腹食用，其二是蜂巢蜜不能长期过量食用，其三是蜂巢蜜不适合高血糖人群食用，其四是蜂巢蜜不适合过敏体质人群食用，其五是蜂巢蜜不适合婴幼儿食用。
